После неожиданного вторжения инопланетян с Юпитера, которое поставило человечество на грань вымирания, лишь Акито смог вернуться на Землю, потрясенный ужасом, пережитым на марсианской колонии. Теперь он живет скромной жизнью повара, пытаясь найти свое место в этом новом мире. Однако, воспоминания о страшных событиях постоянно преследуют его, заставляя искать ответы на мучающие вопросы.

Однажды Акито встречает свою давнюю подругу детства, Юрику, которая теперь является капитаном нового космического корабля "Надэсико". Этот корабль, созданный частной компанией "Нергал" с целью противостоять инопланетной угрозе и разрешить конфликт, который потряс мир, должен отправиться на Марс. Именно на этой планете, где начался кошмар, Акито надеется найти ответы на свои вопросы и разгадать тайну смерти своих родителей.

Присоединившись к экипажу "Надэсико", Акито вступает в борьбу за выживание и раскрытие правды, сталкиваясь с опасностями и загадками космоса. Вместе с новыми друзьями он стремится не только защитить Землю, но и найти смысл в своей собственной судьбе, разгадывая тайны прошлого и сражаясь с неизвестными силами, которые угрожают всему человечеству.